More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1599 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  91.11 
 
 		 177 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 177 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  89.23 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  89.23 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  79.73 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  86.15 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  72.73 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  55.84 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  50.7 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  48.68 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  54.1 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  49.3 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  44.74 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  46.75 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  45.35 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  48.68 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  45.33 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  43.42 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  40.79 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  40.85 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  44.74 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  34.72 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  56 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  34.72 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  43.06 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  51.32 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  58.14 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  37.66 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.55 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>