More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3611 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  313  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  73.75 
 
 		 160 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.67 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  39.05 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.64 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  37.63 
 
 		 283 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 303 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 336 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  40.21 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.86 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  24.43 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  34.07 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  42.25 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>