More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4146 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  36.92 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.88 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  33.05 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.29 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  37.23 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  45.57 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  34.45 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.35 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.28 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.48 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  32.8 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  30.51 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  32.56 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 244 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>