More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1312 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2841  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
158 aa  84  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  45.1 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
303 aa  71.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.01 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.01 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.83 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  39.8 
 
 
287 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.34 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.27 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  35.83 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  52.05 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  40.74 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.28 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  33.81 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  32.88 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  36.07 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
145 aa  60.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
244 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  39.13 
 
 
292 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 
140 aa  58.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3344  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
157 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  28.28 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
199 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  34.69 
 
 
169 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.32 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.32 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.32 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.32 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.32 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.65 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  32.69 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>