More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3155 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  563  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  37.55 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.86 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  32.85 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 171 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  31.72 
 
 		 172 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.12 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  39.33 
 
 		 145 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 143 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.14 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 144 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 164 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 139 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 158 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 138 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 159 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 172 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 161 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 157 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.32 
 
 		 154 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 141 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 165 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 		 178 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 148 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 169 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 159 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 140 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 159 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  27.86 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.72 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 171 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 152 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  33.1 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 148 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 150 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 174 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 162 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 166 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 139 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 		 157 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 143 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 147 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  30.88 
 
 		 165 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 158 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>