More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1458 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
172 aa  353  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  78.11 
 
 
174 aa  268  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
173 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  44.27 
 
 
154 aa  130  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 
142 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 
161 aa  89  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  35 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  36.67 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  40.57 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  29.91 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
201 aa  62  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
192 aa  61.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  33.08 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.96 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 
149 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
143 aa  57.8  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 
142 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  33.08 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  36.08 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.15 
 
 
338 aa  54.3  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.66 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
143 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  37.08 
 
 
138 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.9 
 
 
316 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
148 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
162 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  31.78 
 
 
149 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  30.93 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  29.6 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  23.97 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 
157 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
208 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
143 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>