More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2593 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  292  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  48.06 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  42.86 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  34.81 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  38.28 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  32.19 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  42.55 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.52 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  38.32 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  40.66 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  36.56 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.11 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>