More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2317 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  288  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  55.63 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.17 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.55 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.45 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.77 
 
 		 324 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  27.78 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  32.67 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  32.38 
 
 		 292 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.63 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.34 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  27.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  31.46 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.07 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  31.93 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  31.93 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>