More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2232 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  48.06 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  40.19 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35.25 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.81 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  35.54 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  42.16 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.34 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.3 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30.83 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 307 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  41.44 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  31.75 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  41.75 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  35.05 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>