More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2195 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  98.59 
 
 		 142 aa  276  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  65.32 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  38.76 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.48 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  31.09 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  36.17 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.71 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 178 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.08 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  31.54 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  31.19 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  34 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 214 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.09 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>