More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2856 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  40.25 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  42.14 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 144 aa  85.5  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 143 aa  84.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  37.59 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  35.92 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  36.03 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.71 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.21 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.82 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35.96 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 164 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.79 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  54.76 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25.97 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  30.14 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>