More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2137 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  88.61 
 
 		 158 aa  283  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  87.34 
 
 		 158 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  87.34 
 
 		 158 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 157 aa  198  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  65.79 
 
 		 160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 152 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  35.43 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.38 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  32.39 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.33 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.53 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.53 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.53 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.53 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.53 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  31.91 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.36 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.36 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>