More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4796 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  100 
 
 
157 aa  299  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  48.09 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  40.57 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  45 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  45.19 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  34.29 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.3 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  39.42 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.3 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  51.47 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  35.14 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  37.25 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  36.22 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40.86 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  46.05 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
139 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
189 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  36.03 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>