More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2352 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
173 aa  349  8e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  42.86 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  40.38 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  36.79 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.62 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
146 aa  61.6  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  61.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.68 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
149 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
139 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
152 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
148 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
139 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
141 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
147 aa  54.3  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
141 aa  54.3  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  35.79 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  37.23 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 
139 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
137 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  25.71 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
152 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
156 aa  52  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
151 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
152 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 
140 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
208 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
152 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
138 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  41.11 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
148 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>