More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6019 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  43.27 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  45.54 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  37.72 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 173 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  39.62 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  39.36 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  31.07 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  38.26 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 161 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 163 aa  50.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  46.27 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.81 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>