More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2068 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  274  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  82.14 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  58.41 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  40.41 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  44.44 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  39.81 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.26 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  37.29 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  38.61 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  43.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  42.7 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>