More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1589 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  300  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  42.73 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  40.32 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.9 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  40.54 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  35.56 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  33.82 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.78 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  52 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2360  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00354058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>