More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5540 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  97.06 
 
 		 151 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  97.06 
 
 		 151 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  91.47 
 
 		 151 aa  244  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  75.19 
 
 		 150 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  72.87 
 
 		 150 aa  203  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 189 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.81 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  29.8 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  39.56 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  31.21 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  35.11 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  24.46 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  28 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 169 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  27.21 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>