More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1624 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  90.67 
 
 		 150 aa  254  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  74.26 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  74.26 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  72.79 
 
 		 151 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 151 aa  206  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 166 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 189 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 189 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.06 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  29.29 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  29.63 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  30.91 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  40.51 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  34.07 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  29.05 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  26.35 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  37.31 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>