More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0455 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  36.79 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36.21 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  33.61 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  40.86 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  31.37 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  29.46 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  38.75 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  30.36 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  30.83 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  33.68 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  28.48 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>