More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8410 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  100 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  52.41 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  39.46 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  43.85 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  41.3 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 153 aa  97.1  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 197 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  42.4 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  49 
 
 		 233 aa  94  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  38.97 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 194 aa  91.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  37.67 
 
 		 183 aa  90.5  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 166 aa  87  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  32.67 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  46.74 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  32.39 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 182 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  44.25 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.76 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  38.71 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.15 
 
 		 180 aa  80.5  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  38.79 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  37.09 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  36.72 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  38.68 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  36 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>