More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4259 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
137 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  96.35 
 
 
137 aa  254  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  96.8 
 
 
137 aa  238  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  57.52 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  46.4 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  40.17 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  46.6 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
149 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  41.96 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  41.96 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
233 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  39.18 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
157 aa  77  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  37.93 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  40.17 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  41.11 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  43.82 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  42.53 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
183 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
165 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.96 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  43.69 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  34.57 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
194 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  46.05 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  33.64 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
189 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  42.03 
 
 
164 aa  57  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
175 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  30.28 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.93 
 
 
201 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
149 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  34.04 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  34.04 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
194 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
168 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
194 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>