More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0194 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  73.65 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 233 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  63.19 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  37.93 
 
 		 166 aa  90.5  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  39.32 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  46.74 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  44.57 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  37.86 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  36.63 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  41.59 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  39.62 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  43.68 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  35.45 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.09 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  35.96 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  40.45 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>