More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3240 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  330  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 204 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 		 175 aa  91.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  41.44 
 
 		 201 aa  90.9  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 157 aa  84.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 186 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.53 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.52 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.52 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  32.82 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 310 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  31.94 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  45.83 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.78 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  36.46 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  23.14 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  35.16 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>