More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8699 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 182 aa  347  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  38.85 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  38.13 
 
 		 164 aa  84.3  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  84.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  34.84 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  30.06 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  30.89 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  27.78 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.09 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  40.95 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  27.05 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.05 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  32.28 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13350  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.083551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>