More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2241 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 186 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  52.07 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  53.78 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  47.48 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 194 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 194 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 203 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.43 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.36 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  39.18 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  31.85 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  39.8 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.83 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  28.92 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  29.14 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.25 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.94 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  34.62 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>