170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3485 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  34.26 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4909  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  29.2 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.74 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  35.83 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.5 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  24.22 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.57 
 
 		 310 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  32.33 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 261 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  29.41 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  25.71 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>