More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2687 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  59.44 
 
 		 186 aa  173  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 186 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  49.15 
 
 		 187 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  45.03 
 
 		 201 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  48.78 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  48.78 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.5 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.5 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  29.5 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.73 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.71 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  27.1 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  28.03 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  25.37 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  26.62 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  30.25 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  23.57 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>