More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1285 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  48.65 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.74 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  48.61 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  38.89 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  38.89 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  32.43 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  37.62 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  40.38 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  40.38 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  40.78 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  41.05 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  39.29 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.87 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  40.54 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>