More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2813 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2720  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.88 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  23.36 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.49 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  29.17 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  29.17 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.65 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  29.91 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 340 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  39.71 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 340 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3253  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  28.32 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.84 
 
 		 349 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>