More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04050 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
141 aa  289  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
142 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
142 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  32.61 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  32.37 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2018  transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000120097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  22.7 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
190 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
166 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  31.53 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  29.2 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  31.68 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  31.53 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
173 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
156 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 
156 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  23.66 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  31.62 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  29.7 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
150 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
146 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
150 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
160 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
158 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  27.36 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.36 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
172 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
172 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>