More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1937 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  278  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  34.19 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  34.43 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  32.74 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  31.97 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
180 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 
167 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  29.01 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  30.4 
 
 
163 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
179 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
131 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  22.56 
 
 
143 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
131 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 
191 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
177 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
198 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>