More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0310 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  40.31 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  25.49 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.49 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  25.49 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.49 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1883  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 292 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  26.23 
 
 		 287 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 220 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  28.95 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.18 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  23.96 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  23.96 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  31.82 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  28.72 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  24.42 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  26 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>