More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0706 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  64.79 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  66.19 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  31.53 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.52 
 
 		 159 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.48 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.73 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  25.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  25.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.33 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  32.95 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>