More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1701 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
144 aa  293  6e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  34.96 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  27.34 
 
 
287 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  27.37 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  31.25 
 
 
162 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
303 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  31.51 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  36.25 
 
 
261 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 
161 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  29.57 
 
 
175 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
161 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
151 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.37 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
157 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  26.79 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>