293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11433 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  348  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  55.48 
 
 		 178 aa  153  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  46.31 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  38.56 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 159 aa  95.5  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  39.44 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  32.08 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.01 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  34.72 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.37 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 203 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>