More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5000 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 168 aa  333  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  65.84 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 163 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 163 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 163 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  56.55 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  49.69 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  42.17 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  41.72 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  34.19 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  37.91 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  37.16 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 155 aa  84  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  33.54 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  31.25 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32.68 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  29.33 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  29.79 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  27.14 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>