More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0515 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  283  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 138 aa  150  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 139 aa  141  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  58.21 
 
 		 138 aa  140  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  50.78 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 168 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  50.41 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  45.52 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  37.84 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 220 aa  67  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  37.61 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 150 aa  57  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 191 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.66 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.56 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.96 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.96 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.96 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>