More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2881 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  306  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06420  transcriptional regulator  30.68 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
167 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  33.02 
 
 
188 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.86 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  31.4 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  33.64 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  36.73 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
310 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02510  transcriptional regulator  31.3 
 
 
309 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0329478  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  27.97 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
141 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
180 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
150 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
150 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
150 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  23.2 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.78 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  36.99 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  30.84 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.25 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.8 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  30.86 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  29.91 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
303 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  30.67 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>