More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0456 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  278  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  42.4 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  35.11 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.19 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  37.61 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  27.21 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  35.65 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 179 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>