More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0843 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
157 aa  314  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  57.53 
 
 
154 aa  157  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  56.85 
 
 
154 aa  143  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
144 aa  123  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  44.53 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
148 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
152 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
220 aa  88.2  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.11 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  31.11 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
173 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
171 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
191 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>