More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2518 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  60.74 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  56.72 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  58.51 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  46.27 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 174 aa  60.1  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.24 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>