159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1206 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 220 aa  433  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  49.77 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 144 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  29.63 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.01 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  38.57 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 153 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 155 aa  52  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  38.57 
 
 		 158 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 153 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 139 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 146 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 146 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 142 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 141 aa  48.5  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 153 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 141 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 141 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  32.35 
 
 		 135 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  35.85 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 151 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 150 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>