More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003137 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  95.51 
 
 		 158 aa  302  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  68.79 
 
 		 159 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 174 aa  191  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 181 aa  191  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 160 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  56.49 
 
 		 161 aa  180  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  53.85 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  57.05 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  178  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 157 aa  177  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  55.19 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 157 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  53.55 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  61.97 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 167 aa  164  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  63.24 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  52.03 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  46.1 
 
 		 191 aa  150  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  40.29 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  37.06 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  32.58 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  31 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.78 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>