More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1236 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 153 aa  298  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  51.47 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0351  helix-turn-helix, Fis-type  42.06 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4895  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 200 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30.37 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  33.87 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  33 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  31 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.92 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.42 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  35.92 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  37.33 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  43.48 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  35.78 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  34.15 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>