More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0351 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0351  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4895  transcriptional regulator, MarR family  50.88 
 
 		 158 aa  87.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  41.41 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 182 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.97 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  46.3 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  31.45 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  31.08 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  32.88 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  35.29 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  32.88 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  22.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  42.19 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  47.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  47.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  35.29 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  47.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  47.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  47.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  41.38 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  39.71 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  29.63 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.52 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  30.38 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>