More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3004 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  100 
 
 		 139 aa  286  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  40.31 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.06 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  30.37 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  29.93 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  30.93 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  36.47 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  28.3 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  24.82 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  22.05 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  28.95 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  33.75 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  25.81 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  27.27 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  27.82 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 182 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  24.67 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3835  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>