More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0840 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 170 aa  330  8e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  34.71 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  24.79 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.97 
 
 		 326 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  22.7 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  25.81 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  22.83 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  22.83 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  22.05 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 337 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  22.05 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>