202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0142 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  69.06 
 
 		 139 aa  203  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 139 aa  190  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  32.35 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  34.04 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 		 306 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.46 
 
 		 140 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  29.37 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  31.9 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.05 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  30.91 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  30 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  25.76 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  27.27 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  28.79 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  26.32 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  21.97 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  20.97 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 150 aa  43.5  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 146 aa  43.5  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  26.17 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>