164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4248 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 163 aa  310  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  41.35 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  35.34 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.71 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  38.89 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  38.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  49.06 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  39.08 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.63 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  43.06 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>